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Les parasites sont des organismes eucaryotes qui vivent aux dépens d’autres organismes. Les agents pathogènes constituent un groupe hétérogène dont la structure et le cycle de vie diffèrent parfois de manière significative. Sur le plan morphologique, on distingue les protozoaires (organismes unicellulaires) et les helminthes, plus complexes, qui se présentent sous différentes formes selon leur stade, comme les œufs, les larves et les vers adultes. Les infections provoquent des symptômes très divers, qui dépendent de l’organisme qui les déclenche. Toutefois, ces agents pathogènes ne provoquent généralement pas de maladies potentiellement mortelles, afin d’éviter des dommages trop importants à l’hôte. Les infections peuvent donc passer inaperçues pendant longtemps. Un diagnostic d’urgence n’est généralement pas nécessaire, à l’exception du paludisme.
Les méthodes directes et indirectes sont appropriées pour aider au diagnostic d’une infection parasitaire. L’utilisation d’un seul test de détection n’est pas fiable en raison des cycles de vie généralement très complexes, c’est pourquoi différentes méthodes telles que la sérologie et la détection directe de l’agent pathogène sont combinées.
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